En microscopía, como técnica de imagen, la preparación de la muestra es fundamental, por lo que la unidad cuenta con personal y equipamiento dedicado a la preparación de muestra. La técnica se basa en iluminar una muestra con un haz focalizado de electrones. Una de las características que mejor define a la microscopía electrónica de barrido es su excelente poder de resolución 3,5 nm y Para que se produzca la transmisión de electrones a través de la muestra es necesario que ésta sea delgada, es decir, transparente a los electrones. Este microscopio, permite conocer la ultraestructura de células y tejidos, tanto animales como vegetales.
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